在前期部重点实验室办公室核实农用地质量与监控重点实验室建设成果数据的基础上，按照部科技合作司《关于开展国土资源部重点实验室验收工作的通知》，在部科技合作司和部重点实验室办公室的指导下，2015年2月6日，国土资源部土地整治中心联合中国农业大学在京组织召开农用地质量与监控重点实验室建设验收会。国土资源部科技与国际合作司姜建军司长、文波处长、马梅副处长，国土资源部土地整治中心张晓燕书记、郧文聚副主任，中国农业大学李召虎副校长、吴文良院长、高万林院长出席验收会议。验收组由来自国土资源部高咨中心、中国地质科学院、中国土地勘测规划院、中国科学院地理科学与资源研究所、中国人民大学和中国地质大学（北京）的7名专家组成。
验收会由国土资源部土地整治中心党委书记张晓燕同志主持，原部科技合作司司长黄宗理研究员作为验收专家组组长主持了重点实验室验收程序。
验收会上，中国农业大学李召虎副校长首先致辞；国土资源部土地整治中心副主任、中国农业大学兼职教授、农用地质量与监控重点实验室主任郧文聚研究员从重点实验室定位与研究方向、建设目标完成情况、建设工作主要进展、实验室发展规划和几点体会等方面向验收专家组全面汇报了重点实验室的建设成效；验收专家组认真审阅了重点实验室建设成果资料，实地考察了重点实验室仪器设备和办公设施，经评议、打分和讨论，形成了专家验收意见。
验收组专家一致认为，农用地质量与监控重点实验室在2年多的建设期内，以耕地质量保护、利用与建设为重点，紧扣农用地质量评价与监控、基本农田保护的理论和实践问题，注重研究方向凝炼、重点任务聚集和实践问题探索，发展定位准确，研究方向明确；全面开展研究工作，在农用地质量变化、质量监测方法、多功能诊断与评价等方面的研究达到了国际先进水平，在农用地质量与产能提升、基本农田保护与管理等方面的研究达到国内领先水平；组建的研究队伍具备了参与国际竞争和承担国家重大科研课题及培养高级科研人才的能力；学术交流活跃，开放度高；建立了完备的运行机制，管理规范有序；依托单位提供的实验用房和仪器设备能够满足实验室科研工作的需要；总体建设成效显著，同意通过验收。
李召虎副校长、吴文良院长、郧文聚副主任分别作为重点实验室依托单位领导做了表态发言，就部重点实验室主管部门领导和专家长期以来对重点实验室建设的支持和指导表示感谢，表示在下一步的运行发展中，重点实验室将按照专家和领导的意见建议进行整改落实，在办公用房、专项资金、队伍建设和交流合作等方面进一步加大支持力度，并期望重点实验室以通过验收为起点，进一步加强研究方向的凝练，加强“产学研”的切实结合，在促进重点实验室整体发展上再创佳绩、再上台阶。
最后，姜建军司长做了总结讲话，充分肯定了农用地质量与监控重点实验室的建设成效。他认为，农用地质量与监控重点实验室的建设成就表明了土地科学领域存在大量值得深入研究的科学问题；对于重点实验室下一步的运行发展，他强调，重点实验室的发展关键是要有创新意识，要善于凝练科学问题；他建议，农用地质量与监控重点实验室应着重在以下六个方面加强研究，寻求突破：一是要着眼民生，针对食品安全的迫切性需求研究农用地质量安全问题；二是要着眼系统思维，从岩石圈、土壤圈、生物圈、大气圈4个圈层的有机结合上研究农用地质量要素问题；三是要着眼实践需求，面向当前及未来的重大需求开展创新性研究；四是要着眼成果转化，加强农用地质量相关标准制定，发挥部整土地整治中心在土地整治工程实践方面的优势，加快成果推广应用，服务国家粮食安全目标和农民生产需求；五是要着眼创新发展，要有新思想、新观点、新角度；六是要着眼新装备研发，加强农用地质量快速监测设备的研制。
验收会结束后，举行了简单的农用地质量与监控重点实验室授牌和揭牌仪式。由姜建军司长为部土地整治中心张晓燕书记和中国农业大学李召虎副校长授牌，姜建军司长、张晓燕书记、李召虎副校长、黄宗理组长共同为重点实验室揭牌。
农用地质量与监控重点实验室副主任、5个研究方向负责人和其他固定成员约40余人参加了验收会。